Jetzt, einer zweiten Methode,
um Quote naten zu berechnen, aufgrund gemessener Abstände.
In deinen 80er gab es so eine gröbe Leute,
die sagten, wir haben einfach eine Optimierungsproblem her.
So, Optimierung bedeutet, wir haben nur ein Kostfunktion,
die wir minimären wollen. Und was ist unsere Kostfunktion?
Wir wollen koordinatern in deinem, irgendeinem Abstand Day-I,
also Sonar wie möglich,
an ein gemessener Day-I lade
So in unserer Kostfunktion ist dieser Unterschied Hook 2.
Und das müssen wir über Ala, E-Abstände zu nähern.
Ja, klingt so einfach. Ist nicht. So,
das Erste, das erste, der erste Edai war.
Wir haben eine Menge Quodinaten in diesem Tal her.
Aber das bedeutet für In-Atomen haben wir drei En-Variable.
Twy in Premital Steammon anpassen müssen. Vielleicht ist es einfacher
, mit Winkelung zu arbeiten. So,
um einen Konfirmationen für diese PepTN zu finden, kann man
die Bindungslänge aus Festbetrachten und einfach mit diesen Winkeln arbeiten.
Ja, und das klingt logisch und es ist.
Soll für En-Atomen, hat man ungefähr Entbindungen.
Das ist empörtisch
die Wahrheit
Dieses Optimierungsproblem ist nicht so einfach. Hat man einen Winkel unter einen Abstand,
soll wie in dieses Bild her, ist das Problem einfach.
Man hat eine klare Abhängigkeit des Abstands auf deinem Winkeln her.
So, Jesu Funktion kann man sehr schnell optimieren.
Und Optimierung bedeutet, ein Winkel finden, das ein gemessener Abstand passt.
Hat man einen Pretain mit einem gemessenen Abstand von hier bisher,
dieser am Stand ist von vielen Winkeln abhängig.
Unser Problem ist schlimmer noch. Passt man dieser Winkelung an,
um einen Good Wert für diese Abstand zu finden?
Mattmann irgendeiner anderer Abstand kaputt. So, wir haben in
Winkeln zu optimieren, aber sie sind in unserer Kostfunktion,
sind sie nicht voneinander, unabhängig.
Und sie dürfen nicht sagen, oh,
kann ich Simuise oder Neiling nutzen oder schlimme noch,
darf ich schon ein genetischer Algorithmus nutzen?
Nein, fragen Sie mich, fragen Sie mir in einer Söhn-Session.
Die schneller antwortest, die The Kram,
das Silkram ist einfach zu groß.
Und voll von Loke Hower minimal
So, just problem is just yeah do winkeln ist mit
vier Abständen verbunden. So, einfache Optimierungsmethoden werden nicht funktionieren.
Man darf nicht allgemeine Optimierungsmethoden anwenden, weil sie funktionieren nicht.
Wir haben zu viele Abhängigkeiten in diesem System. So,
die Gedanken von Werner Braun und He do go heißen sie,
war, können wir dieses Problem, um formulieren,
um dass es besser für ein einfacher Optimierungsalgorithmus passt.
Und das haben sie genannt
So, wie haben Sie das Problem ungewandert oder was ist Ihre Strategie? Ich erkläre da grob und danachhin schmerzhaftiger Detar. So,
hier ist unsere Spirunzeugs-System, ein kleiner Pep Tate,
was die Magnecy optimierung, jeden Winkel am Anfang,
aber für die Kostfunktion für diese Winkelung zum Beispiel,
am Anfang betrachten sie nur Abstände in Haut,
ein paar Bindungen her oder ein paar Bindungen her,
dann enden sie ihre Kostfunktion und für diese Winkel und die ist auch ein Dayser,
betrachten sie ein paar mehr Abstände und schrittweise erwarten sie die Bindungsabstände,
die sie betrachten,
soll sie fangen mit ein paar,
mit Auerwinkeln,
aber nur ein paar gemessene Abstände und dann ist die Struktur Local Richtik,
dann setzen sie ein paar mehr Abstände hin zu und optimieren sie weder und ein paar mehr Abstände und Servanche.
So,
jetzt in schmerzhaftiger Detar
Hier ist irgendeiner Peptate. Und betruckten sie als Beispiel,
die deinen Abstand zwischen diesem Portaun und D-Supreme Ton.
Dieser Abstand entsprickt ein paar Rester, die benachbarend sind,
sondern man könnte sagen, Reste zwischen Abstände zwischen Resta I und E plus 1.
Aber ein Abstand hätte oder habe ich schon am Stand gemessen von hier bis hier,
das sind Sprittren, das entsprickt an Sequenziell-Abstand von Swag.
So, S-on-Stadt 2, The Resolvester. So,
jeder gemessener Abstand entsprickt, irgendeinem, Trennung, Abstand,
sequenzbezogen. So in der ersten Schrift betrachtet man gemessene Abstände
zwischen benachbarter Alester
So, vielleicht habe ich diesen Abstand gemessen und diesen Abstand und diesen Abstand und DS-Abstand.
Und sie sind zwischen Bernachnachbarter Rester. So,
ich hoppte mir auch alle Winkeln, aber in meiner Kostfunktion,
vertrackte ich nur Abstände zwischen benachbareter Rester.
Danach behalte ich diese erste Abstände her, aber,
und die sind diese her, aber dazu setze ich
ein paar mehr Abstände zwischen Rester mit einer Sequenz bezogenen Abstand von 2.
So presst er i und epus 2. So, ich habe
mein Kostfunktion geändert oder erweitert. Und dann optimiere ich,
wie vorher, aller Winkel. Und in dem dritten Schritt
erweitere ich meine Sammlung von Abständern und meinen Kostfunktionen,
so wie ich behaute, dieser Abstände, so diese Heer.
Und dazu habe ich zusätzlich zusätzlich gemessene Abstände zwischen Rester
mit einer größeren Abstandort zwischen Sequenz bezogen.
So, und nochmal, Schrittweiser durch diesen Prozess
Ich habe am Anfang einfach experimenteller Informationen.
So, ich habe Atom 1, unser Tome 2.
Ich weiß von Wolfsburg, er resste sie stammen. So,
Alpha Wasserstoff von Westerfilm vor der Erfenwassenschaft von Reste At ist Bregna,
dieser 6, minus 5, bedeutet, sie sind benachbarte Reste.
Oder ich habe einen Abstand zwischen Öster 2 und 2 und
Aktien gemessen, soll die Sequenz bezogener Abstand ist Aktien.
So, ich habe ein Tabeller von Auer gemessener Abstände,
dann sortiere ich diese Tabeller aufgrund ihrer Sequenz
bezogener Abstand
So, ich habe am Anfang Abstände im Hauptarenreste,
zum Beispiel zwischen neuen Alpha-Protonen und einem Gamer-Protonen, innerhalb Rester Up here.
Danach habe ich Abstände zwischen benackbarer Turreste und dann Rester,
die, die ein Sequenzbezogene Abstand von zwei haben und soll weiter.
In meiner ersten Schritt,
Volkes nutze ich nur die erste Grüppe von Abstände,
dann erweitere ich meine Kostfunktion mit mehrerer Abstände und mehrerer Abstände
und am Ende des Verfahrens betragte ich
aue Gemesserabstände
So, in 1990 habe ich einen Vortrag von Werner Braun gehört.
Und hier ist mein Versuch, ein Bild wiederzumalen. So,
die ihr da ist, wir haben am Anfang ein,
hier ist unsere Kostfunktion und Hede ist ein Raum mit auer möglicher Konfirmation.
Am Anfang haben wir fast keine Lokaler minimal.
Und es ist einfacher ein Goalbar und Minimum
zu finden
Speicher, aus wir mehrere Abstände hinzufügen, bekommen wir mehrere
und mehrere lokal Manager. Aber das machen wir aumelig.
So, wir verlieren nie unserer ursprünglich gut gefundenen Minema.
So, ganz am Ende haben wir Aua Hügo in unserer Kostlandschaft eingebärt.
Und man sollte ein Goldbauer, optimal Optimum finden.
Das ist nicht der Fall, aber man findet ein Guschelminimum
Wir sollten die Veribultarge-Funktion und Metric Mytrix-Funktion miteinander vergwaken.
Beide sind heutzutage benutzt, aber es ist genau wie Streiten
zwischen Cattle League und Protestantin oder zwischen Sunnys und Schädern.
Die Diskussion ist nicht immer rational. Es gibt Unterschiede zwischen diese zwei Enthodeln
. Die verible Target-Funktion ist für Light unter Spectro Scoper,
ein bisschen bevorzugt, weil es keine Probleme mit Kerautheit gibt.
Das ist ein größer Vorteil. Es gibt auch Nachteile,
die verible Target-Funktion passt nur für klassischer Caterer-Polonara, wie Pertainer.
Und würde man diese Methode auf Nykriotailer anzuwenden,
muss man fehle neuer Köln schreiben. Und das ist da
eine Actor-Nothouse. Es ist sehr auf bestimmte Guy-Amaterie bezogen.
Und die Metric Mytrix-Method ist für Light dann allgemeinere Methode von Abständen,
lässt es bestimmt ein allgemeinere Methode,
von Abständen nach Quodenarschern ans System umzuwandern.
So,
ich mag beide Methoden in unterschiedlicher Kontexte
Wie seht euer Acte-Implementation von Distance Geomangerie Ass?
Sie sind keiner kleiner Programme. Wahl als Input mütte man
einfach ein Peutin-Sequenz einleisen und eine Sammlung von Abständen.
Unter nutzliches Programm muss Sauer, Power, andere Details ausatmen.
So, die Mehrheit, that silent this codes, ist Buchhaltung.
So, bibliotaken from Game of von Matree von Armeen und Säuren.
Und kalt um die Gayo Matree zu nutzen. So,
von einer Beschreibung aus einer Bibliothek, um zu sagen,
dass diese Bindungen, dass dieser Morcul, Harana,
Bindung von dieser Art mit dieser Länge und Auenwinkung und so weiter.
Und das ist schwieriges kalt zu schreiben,
ohne zu schwere Banks zu haben
Ich habe bis jetzt zusätzlicher Informationen nicht erweint. Vergessen Sie nicht,
dass es gibt, ein bisschen Informationen über Winkorn.
Soll von J3 oder Spin-Spin-Coupling meistens. So,
wir wissen, dass diese Atomen her haben zwischen Leseatomen her,
gibt doch ein bestimmtes Winkorn.
Wie Berlsmann diese Informationen ein? Für die Metric-Mindtricks-Methode ist es
nicht schwierig, für euren gegabenen Winkorn kann man Abstände berechnen.
Und das Berlsmann aus Anzahl in vielleicht direkt in deinem Trial-Matrix ein.
So, das ist dein Fuck. Für die verible Target-Funks-Funktion
, es ist überhaupt kein Problem. Diese Methode Arbaget-Methosionswinklung,
so man matt ein paar rovante Winkorn einfach fest oder
fast fest